RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SSTR4P31391 388 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 RGRP47804 291 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PPP3CCP48454 512 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 INPP1P49441 399 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ACLYP53396 1101 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SCML2Q9UQR0 700 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 A8MUA0 341 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SNX4O95219 450 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 UROSP10746 265 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 IL7P13232 177 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2A7P20853 494 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 DNASE1L2Q92874 299 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TP53INP1Q96A56 240 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PHF21AQ96BD5 680 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 DYRK4Q9NR20 520 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.77■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 H3BM21 787 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GJB5O95377 273 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 FGF4P08620 206 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PSKH1P11801 424 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRNQ16849 979 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CARD16Q5EG05 197 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RTP2Q5QGT7 225 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GPSM1Q86YR5 675 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ULK4Q96C45 1275 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 REEP1Q9H902 201 aa15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 I3L521 148 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 BNIP3LO60238 219 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFD2P13995 350 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TYMPP19971 482 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF675Q8TD23 568 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 F5H5T6 163 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM12O43184 909 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 LDB2O43679 373 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 GRK5P34947 590 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DAPP51397 102 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SEMG2Q02383 582 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TAF12Q16514 161 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 Q5BKY6 102 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A13Q96H72 371 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TSSK3Q96PN8 268 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP21Q9H596 190 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MKLN1Q9UL63 735 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MYLKQ15746 1914 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 IQCF5A8MTL0 148 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ERN1O75460 977 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJB1P25685 340 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RYKP34925 604 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 TGM4P49221 684 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK12P53778 367 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 CRISP3P54108 245 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 ELP6Q0PNE2 266 aa15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CCSAP-204ENST00000483092 RNF180Q86T96 592 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms