RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PRKAR1AP10644 381 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PTPN4P29074 926 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A2P55011 1212 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CDC20Q12834 499 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TCTE1Q5JU00 501 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 C1orf189Q5VU69 101 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 C16orf46Q6P387 395 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FBXL8Q96CD0 374 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FMO2Q99518 471 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NDC1Q9BTX1 674 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SGPP1Q9BX95 441 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FAM117AQ9C073 453 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ACTL8Q9H568 366 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SNX7Q9UNH6 387 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RECKO95980 971 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RELAQ04206 551 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ERV3-1Q14264 604 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 OR56A3Q8NH54 315 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 MED8Q96G25 268 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FUT8Q9BYC5 575 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NLNQ9BYT8 704 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 H7BY64 318 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 GUCA1CO95843 209 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FURINP09958 794 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NPPBP16860 134 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 STMN1P16949 149 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 AGXTP21549 392 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CCND1P24385 295 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PHBP35232 272 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ARSFP54793 590 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 GRM7Q14831 915 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LCTLQ6UWM7 567 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CATSPER2Q96P56 530 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 OR2A5Q96R48 311 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CYTH2Q99418 400 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 DERL2Q9GZP9 239 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CUTCQ9NTM9 273 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 H0YGG7 62 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 HAT1O14929 419 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ITGAXP20702 1163 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ALAS2P22557 587 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 HRH2P25021 359 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RAB10P61026 200 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 IFT20Q8IY31 132 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 EXD3Q8N9H8 876 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ATL1Q8WXF7 558 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A7Q92504 469 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PYCR2Q96C36 320 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NFU1Q9UMS0 254 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 OARD1Q9Y530 152 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 HMX2A2RU54 273 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CDC14CA4D256 554 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 MED26O95402 600 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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