RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TRIB3Q96RU7 358 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TTC1Q99614 292 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 THSD1Q9NS62 852 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.09□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SPTBP11277 2137 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 A0A088AWK7 358 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 A8MT66 165 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 E9PBE3 544 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 H7C0S8 307 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PSMD11O00231 422 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PLD2O14939 933 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PPM1DO15297 605 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GRID2O43424 1007 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KLHL41O60662 606 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 VPS4BO75351 444 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NDUFS3O75489 264 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CHRNGP07510 517 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 JMJD7P0C870 316 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GLB1P16278 677 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ATP6V1C1P21283 382 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PIK3R1P27986 724 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MAPK9P45984 424 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TTPAP49638 278 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ATP4BP51164 291 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ARSDP51689 593 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 XIAPP98170 497 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DLG1Q12959 904 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CDC16Q13042 620 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 STX5Q13190 355 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CUL3Q13618 768 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SQLEQ14534 574 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RCN1Q15293 331 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MUM1Q2TAK8 710 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CUZD1Q86UP6 607 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 VASH2Q86V25 355 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NAGSQ8N159 534 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 USP7Q93009 1102 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PMEPA1Q969W9 287 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EID2BQ96D98 161 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OR2M4Q96R27 311 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OLFM1Q99784 485 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NUF2Q9BZD4 464 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 STRADBQ9C0K7 418 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DERL2Q9GZP9 239 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PIF1Q9H611 641 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 YY1AP1Q9H869 796 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KCNK6Q9Y257 313 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.08□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms