RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 GPR45Q9Y5Y3 372 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 B2RBV5 119 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PCNAP12004 261 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 EMX2Q04743 252 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 AGKQ53H12 422 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 MED27Q6P2C8 311 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SNX32Q86XE0 403 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM48Q8IWZ4 208 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LMX1AQ8TE12 382 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SLC45A3Q96JT2 553 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 AIG1Q9NVV5 245 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ATP4BP51164 291 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CORO7P57737 925 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 STX1BP61266 288 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GPR18Q14330 331 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 FAM129CQ86XR2 697 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SLC37A2Q8TED4 501 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LRTM1Q9HBL6 345 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 TAS2R1Q9NYW7 299 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PIPSLA2A3N6 862 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 H7BY64 318 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KDM1AO60341 852 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SEC22BO75396 215 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 VIPP01282 170 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 IDO1P14902 403 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PTPN4P29074 926 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PRDX6P30041 224 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RASSF2P50749 326 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RPL38P63173 70 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RPS6KA2Q15349 733 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GSTA3Q16772 222 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 IL23RQ5VWK5 629 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ICE2Q659A1 982 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GK5Q6ZS86 529 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HUS1BQ8NHY5 278 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GAB3Q8WWW8 586 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PRAP1Q96NZ9 151 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LRMDAQ9H2I8 198 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM74BQ9NUR3 256 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SERTM1A2A2V5 107 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 MAGEB17A8MXT2 336 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HRO43593 1189 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 THRAP10827 490 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SHMT2P34897 504 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 C21orf59P57076 290 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ELOCQ15369 112 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PAGE2BQ5JRK9 111 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LYSMD4Q5XG99 296 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PMS2CLQ68D20 193 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 MIER2Q8N344 545 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf109Q9NX04 203 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GVT2 93 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 OR5K4A6NMS3 321 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 B4DGG1 531 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GPR37L1O60883 481 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KCNJ2P63252 427 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA0040Q15053 153 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 FUNDC1Q8IVP5 155 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LAS2Q8IYD9 372 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ABHD11Q8NFV4 315 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 OR6C2Q9NZP2 312 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0G2JNG1 304 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS3K7RE56 304 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 BTN3A3O00478 584 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SH3BGRLO75368 114 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS5Q14953 304 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PLCL1Q15111 1095 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 APIPQ96GX9 242 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 TEX37Q96LM6 180 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 BTBD10Q9BSF8 475 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 POT1Q9NUX5 634 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 MRGBPQ9NV56 204 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 C9JVG2 144 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 YY2O15391 372 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SDC3O75056 442 aa26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms