RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465721.1

CNOT4-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, human

TSL 4

Gene CNOT4, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT4-208	ENST00000465721	RBPJ	Q06330	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ALG3	Q92685	438 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	WFS1	O76024	890 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CLDN14	O95500	239 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	C1orf105	O95561	183 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TPM1	P09493	284 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CXCR2	P25025	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MAGEA1	P43355	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	EMP3	P54852	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	P3H1	Q32P28	736 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721		H0YGG7	62 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	FOXS1	O43638	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TJP3	O95049	919 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	HEXB	P07686	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CAPN3	P20807	821 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SLC26A3	P40879	764 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SMS	P52788	366 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CASP6	P55212	293 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	AP2B1	P63010	937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TMED2	Q15363	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	GPR137	Q96N19	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TTC1	Q99614	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ERG	P11308	486 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CDH17	Q12864	832 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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