RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF839A8K0R7 811 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 H3BM21 787 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MID1O15344 667 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 YY2O15391 372 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM23O75077 832 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR89BP0CG08 455 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2ADP20671 130 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 NKG7Q16617 165 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 NEIL2Q969S2 332 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HIC2Q96JB3 615 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OLAHQ9NV23 265 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAB26Q9ULW5 256 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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