RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TEX101Q9BY14 249 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB17Q9H0T7 212 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NAPBQ9H115 298 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 VCXQ9H320 206 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MROH2AA6NES4 1674 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AGLP35573 1532 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ERBINQ96RT1 1412 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SBNO1A3KN83 1393 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 UBE4BO95155 1302 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0A0MQY5 61 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEB16A2A368 324 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 VCYO14598 125 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HDAC3O15379 428 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SPOPO43791 374 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SSX4O60224 188 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GCATO75600 419 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RHOBTB1O94844 696 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLITRK3O94933 977 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFB4O95168 129 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MBD3O95983 291 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SBK2P0C263 348 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TFPIP10646 304 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CDK4P11802 303 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF18P17022 549 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CDH3P22223 829 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AXLP30530 894 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB6P35237 376 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HSD17B3P37058 310 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SOX2P48431 317 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC9A3P48764 834 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HTR6P50406 440 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGDIBP52566 201 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PTENP60484 403 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CCNA1P78396 465 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 BLOC1S1P78537 153 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 S100A12P80511 92 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GIT2Q14161 759 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MOGQ16653 247 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TXNRD1Q16881 649 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SYTL3Q4VX76 610 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL26Q53HC5 615 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF6Q58WW2 860 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ALG10Q5BKT4 473 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PCID2Q5JVF3 399 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CENPPQ6IPU0 288 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR27Q6MZM9 219 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 Q6ZRM9 215 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MTSS1LQ765P7 747 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NOXA1Q86UR1 476 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC51BQ86UW2 128 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.3□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GALNT16Q8N428 558 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms