RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PADI2Q9Y2J8 665 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC88CQ9P219 2028 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GX78 115 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FITM1A5D6W6 292 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NRP2O60462 931 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PMS2P54278 862 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PLTPP55058 493 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ABATP80404 500 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CAV1Q03135 178 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PAQR7Q86WK9 346 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC138Q96M89 665 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 EPN3Q9H201 632 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PDE10AQ9Y233 779 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0J9YVX5 310 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DSCR3O14972 297 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CD63P08962 238 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SSTR1P30872 391 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PGGT1BP53609 377 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FRMPD2BQ6IN97 320 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF425Q6IV72 752 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C8orf74Q6P047 294 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RHOJQ9H4E5 214 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CUTCQ9NTM9 273 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MED13Q9UHV7 2174 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RFPL1O75677 317 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ONECUT2O95948 504 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GSTA2P09210 222 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GP1BBP13224 206 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 EZRP15311 586 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2ADP20671 130 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ALAS2P22557 587 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 AP1S2P56377 157 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TBPL1P62380 186 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RELAQ04206 551 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TRADDQ15628 312 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PHKG1Q16816 387 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM214AQ32MH5 1076 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MLIPQ5VWP3 458 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF592Q92610 1267 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDKL2Q92772 493 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FKBP10Q96AY3 582 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 VPS39Q96JC1 886 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HIST1H2AJQ99878 128 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 H2AFJQ9BTM1 129 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCF3Q9NUQ8 709 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HYKKA2RU49 373 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 H0YGG7 62 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PIAS1O75925 651 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBB4AP04350 444 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms