RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 GLRX2Q9NS18 164 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLIC1O00299 241 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OGTO15294 1046 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MED7O43513 233 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPRIN2O60269 458 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UGDHO60701 494 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HPGDSO60760 199 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK2O95069 426 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MMP1P03956 469 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 POU2F2P09086 479 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2C8P10632 490 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PF4V1P10720 104 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF250P15622 560 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MCAMP43121 646 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R40P59535 323 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GAD2Q05329 585 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PRKAA1Q13131 559 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TATDN3Q17R31 274 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 VHLLQ6RSH7 139 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 REC114Q7Z4M0 266 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PROSER1Q86XN7 944 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LIX1Q8N485 282 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF383Q8NA42 475 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA20Q8TB22 786 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MBOAT7Q96N66 472 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RDH12Q96NR8 316 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.46□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NAGPAQ9UK23 515 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LDLRAD4O15165 306 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LRRTM2O43300 516 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BANF1O75531 89 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LATS1O95835 1130 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MT-CO2P00403 227 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RAF1P04049 648 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CYP11A1P05108 521 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 APRTP07741 180 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 BAG6P46379 1132 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 AP1S1P61966 158 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MYL7Q01449 175 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GCNT1Q02742 428 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRRQ15256 657 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CARD16Q5EG05 197 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 REPS2Q8NFH8 660 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ART4Q93070 314 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT11Q96G61 164 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC17Q96LX7 622 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PKIBQ9C010 78 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MTG2Q9H4K7 406 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DTLQ9NZJ0 730 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NLKQ9UBE8 527 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SIAH2O43255 324 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TAF5LO75529 589 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 F9P00740 461 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FBP1P09467 338 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ETS1P14921 441 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B7P16662 529 aa5.46□□□□□ -1.54
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