RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442026.1

LINC01317-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1317, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01317, Length 677 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01317-202ENST00000442026 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TRIM58Q8NG06 486 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 IRGQQ8WZA9 623 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 VPS33BQ9H267 617 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TMEM206Q9H813 350 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 EBF2Q9HAK2 575 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 GKN1Q9NS71 199 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PDRG1Q9NUG6 133 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SLC38A7Q9NVC3 462 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TRIM17Q9Y577 477 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TMEM94Q12767 1356 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TAF1P21675 1872 aa3.5□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 DUXAA6NLW8 204 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 YDJCA8MPS7 323 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TTI1O43156 1089 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ATP8B1O43520 1251 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SYNGR3O43761 229 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 IGKV2-30P06310 120 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 NGFRP08138 427 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 IRF2P14316 349 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 FERP16591 822 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 JAK1P23458 1154 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 MNDAP41218 407 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 HNF4AP41235 474 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 KCNJ1P48048 391 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 FUT6P51993 359 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 THOP1P52888 689 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PDX1P52945 283 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 MFAP3P55082 362 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 MTCP1P56278 107 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 GSDMDP57764 484 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 LINC00205P59089 165 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 BPIFB3P59826 476 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 RCN2Q14257 317 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 NPTX1Q15818 432 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 INAQ16352 499 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TAZQ16635 292 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 CA9Q16790 459 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SMUG1Q53HV7 270 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 CASC4Q6P4E1 433 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TEX9Q8N6V9 391 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 BMPERQ8N8U9 685 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PROX1Q92786 737 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 RIT1Q92963 219 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ZNF479Q96JC4 524 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 C8orf76Q96K31 380 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 C17orf77Q96MU5 243 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SNX25Q9H3E2 840 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 DBNDD1Q9H9R9 158 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 C2CD2Q9Y426 696 aa3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 AK9Q5TCS8 1911 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 A0A1W2PPI3 338 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 A0A1W2PPK0 400 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 M0QX08 132 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 NDUFAB1O14561 156 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 ST8SIA3O43173 380 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 PPIP5K2O43314 1243 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SLC28A2O43868 658 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 NEMFO60524 1076 aa3.48□□□□□ -1.85
LINC01317-202ENST00000442026 SELENOFO60613 162 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms