RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2L3Q8NG85 312 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NETO1Q8TDF5 533 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCT6BQ92526 530 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEIL2Q969S2 332 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAR2Q96K12 515 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TGM7Q96PF1 710 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB33BQ9H082 229 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EHD1Q9H4M9 534 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POMT2Q9UKY4 750 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNX7Q9UNH6 387 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 E7EQ34 232 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GFRA3O60609 400 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ESRRBO95718 433 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPNE6O95741 557 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT6AP02538 564 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT6BP04259 564 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK4P11802 303 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HGFP14210 728 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPPBP16860 134 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPAN8P19075 237 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNF4AP41235 474 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT6CP48668 564 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HK2P52789 917 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFT88Q13099 833 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ILKQ13418 452 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPIDRQ14159 915 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBCCQ15814 346 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATG9BQ674R7 924 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTLQ8NG68 377 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf26Q96N11 449 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2A14Q96R47 310 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4K3Q96R72 315 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTMT1Q9BV86 223 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACSS2Q9NR19 701 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNX6Q9UNH7 406 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASB1Q9Y576 335 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 U3KQA8 63 aa9.88□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PPV9 198 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR7A17O14581 309 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDF9O60383 454 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RFPL3O75679 317 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHRNGP07510 517 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TGM1P22735 817 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTM2P28161 218 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERPINB1P30740 379 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GYS2P54840 703 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 E2F1Q01094 437 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNC4Q03721 635 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAF3Q13114 568 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC157Q569K6 752 aa9.87□□□□□ -0.83
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PERM1Q5SV97 790 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms