RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCK2Q9BZX2 261 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DERL2Q9GZP9 239 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMGCS1Q01581 520 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAM15Q13444 863 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C4orf46Q504U0 113 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COQ8BQ96D53 544 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL21A1Q96P44 957 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR22Q99680 433 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC42Q9Y546 428 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN4O14817 238 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MBLAC2Q68D91 279 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM17Q86X19 198 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRBC2A0A5B9 178 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C5orf51A6NDU8 294 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9IYK1 514 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLPXO76031 633 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD72P21854 359 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GJA9P57773 515 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPY5RQ15761 445 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NR4A3Q92570 626 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCO2Q9BYV7 579 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF69Q9UC07 566 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR3A3P47888 321 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR3A2P47893 321 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GSK3BP49841 420 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PMEPA1Q969W9 287 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL12RB2Q99665 862 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIGVQ9NUD9 493 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1I1O60431 355 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 YES1P07947 543 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRKCHP24723 683 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRD7Q9NPI1 651 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PRQ8 180 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM233B4DJY2 109 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCHEP06276 602 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FPR1P21462 350 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APLP1P51693 650 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC32Q14392 662 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SEMA3AQ14563 771 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AVL9Q8NBF6 648 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRHL3Q8TE85 626 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MLXQ9UH92 298 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BNIP3Q12983 259 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CMAHPQ9Y471 501 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VIPR1P32241 457 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NRLP54845 237 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKFN1Q8N957 763 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BSA7 217 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RCBTB2O95199 551 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TGFB1P01137 390 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITGB1P05556 798 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RB1P06400 928 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HK1P19367 917 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UFM1P61960 85 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SP140Q13342 867 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NXPE2Q96DL1 559 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms