RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426538.6

GINS3-203, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-203ENST00000426538 A0A1B0GTW7 788 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SERTM1A2A2V5 107 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SEC22BO75396 215 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 KRT34O76011 436 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 THRAP10827 490 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PIK3R1P27986 724 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PRDX6P30041 224 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ATP4BP51164 291 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CCR8P51685 355 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HMGCS1Q01581 520 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 EMX2Q04743 252 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 NAA25Q14CX7 972 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ICE2Q659A1 982 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 OR7G3Q8NG95 312 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PATE1Q8WXA2 126 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PELI2Q9HAT8 420 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ISM1B1AKI9 464 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 B4DGG1 531 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 YY2O15391 372 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 AQP9O43315 295 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PSMB5P28074 263 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PHEXP78562 749 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 GPR18Q14330 331 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SMU1Q2TAY7 513 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PLK5Q496M5 336 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CEP68Q76N32 757 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MIER2Q8N344 545 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 KLHL29Q96CT2 875 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 C1orf50Q9BV19 199 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ACPTQ9BZG2 426 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 BRF2Q9HAW0 419 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 C1orf109Q9NX04 203 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 KNL1Q8NG31 2342 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 NCOR1O75376 2440 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 A0A1B0GVT2 93 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PIPSLA2A3N6 862 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 H7BY64 318 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HRO43593 1189 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CCNDBP1O95273 360 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 COX4I1P13073 169 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HSD3B1P14060 373 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HSD3B2P26439 372 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PTPN4P29074 926 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CNR2P34972 360 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 DIO3P55073 304 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 NCALDP61601 193 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ABATP80404 500 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MXRA7P84157 204 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HHEXQ03014 270 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 MAPRE2Q15555 327 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 AGKQ53H12 422 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 LAS2Q8IYD9 372 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 AVL9Q8NBF6 648 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 USP34Q70CQ2 3546 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 B2RBV5 119 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 ANXA6P08133 673 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-203ENST00000426538 CMPK1P30085 196 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms