RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 CEACAM7Q14002 265 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 Q6ZSR6 202 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FAM129CQ86XR2 697 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 APIPQ96GX9 242 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 HHIPQ96QV1 700 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FOXQ1Q9C009 403 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CROTQ9UKG9 612 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 A0A1W2PPV9 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 NPPAP01160 153 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 MAPK1P28482 360 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 RAB28P51157 221 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 RPE65Q16518 533 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SIX5Q8N196 739 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LIX1Q8N485 282 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DPP10Q8N608 796 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 VPS33AQ96AX1 596 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PPT2Q9UMR5 302 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 A0A1W2PPC4 97 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PIPSLA2A3N6 862 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CFLARO15519 480 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ALG11Q2TAA5 492 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 GJD3Q8N144 294 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 RNF175Q8N4F7 328 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 OR13H1Q8NG92 308 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 UBE2E3Q969T4 207 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CLDN23Q96B33 292 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LRRC58Q96CX6 371 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 GPR174Q9BXC1 333 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CLMPQ9H6B4 373 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 GID8Q9NWU2 228 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 A6NCN8 305 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SDC1P18827 310 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ME2P23368 584 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PKLRP30613 574 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PIK3CBP42338 1070 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CLDN8P56748 225 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 JADE3Q92613 823 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 NRTNQ99748 197 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 DPY30Q9C005 99 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PELI2Q9HAT8 420 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CD300AQ9UGN4 299 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 TAC3Q9UHF0 121 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 ETHE1O95571 254 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IL6P05231 212 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CDH1P12830 882 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NDUFS1P28331 727 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C17orf64Q86WR6 236 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms