RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 IL10P22301 178 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TEAD1P28347 426 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 HTR1EP28566 365 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 GJA4P35212 333 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CASP2P42575 452 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 GPR1P46091 355 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RPA4Q13156 261 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MED21Q13503 144 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MTX3Q5HYI7 312 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ANO7Q6IWH7 933 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 VRK3Q8IV63 474 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 STARD8Q92502 1023 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CHFRQ96EP1 664 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SPACA7Q96KW9 195 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf50Q9BV19 199 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 DPY30Q9C005 99 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MTG2Q9H4K7 406 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CMTM6Q9NX76 183 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RAB26Q9ULW5 256 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 INVSQ9Y283 1065 aa9.73□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTS20P59510 1910 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ASPDHA6ND91 283 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AG2A6NM03 316 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PATE3B3GLJ2 98 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 H0YIV9 168 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 H3BM21 787 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 FFAR3O14843 346 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CLGNO14967 610 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 GPR42O15529 346 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SPINT1O43278 529 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MAP3K13O43283 966 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MTX2O75431 263 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 KAT7O95251 611 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 KCNH1O95259 989 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 APODP05090 189 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 C6P13671 934 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PEX2P28328 305 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 IL12AP29459 219 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 OPRD1P41143 372 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TNFRSF4P43489 277 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CTSCP53634 463 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CLDN8P56748 225 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PFN3P60673 137 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 IRF8Q02556 426 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ENPP2Q13822 863 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 E2F2Q14209 437 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA0040Q15053 153 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 AGERQ15109 404 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 LPCAT4Q643R3 524 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 FRG2Q64ET8 278 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 OR56A3Q8NH54 315 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 VPS33AQ96AX1 596 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 REPS1Q96D71 796 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 TEX37Q96LM6 180 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 FRG2BQ96QU4 278 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ALG2Q9H553 416 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 ACTL8Q9H568 366 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 CLMPQ9H6B4 373 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 RMND5AQ9H871 391 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 NANOGQ9H9S0 305 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 BRF2Q9HAW0 419 aa9.72□□□□□ -0.85
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms