RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS26AO75436 327 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP10O95393 424 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F10P00742 488 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNB1P01574 187 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELA2AP08217 269 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMP3P54852 163 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YBX1P67809 324 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OASLQ15646 514 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO7BQ6PIF6 2116 aa12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPH7Q9BTV6 452 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABI3Q9P2A4 366 aa12.53□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC14AQ9UNH5 594 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZD2O15018 2839 aa12.52□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR42O15529 346 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIASO43766 372 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF2O75151 1096 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFS1O76024 890 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC5CO95185 931 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FTCDO95954 541 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGER4P35408 488 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAAH2Q6GMR7 532 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF7Q7Z4P5 450 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1A1LQ8N752 337 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF32Q9H0A6 362 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNPO2LQ9H987 977 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12.52□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB6BQ9NRW1 208 aa12.52□□□□□ -0.41
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFS3O75489 264 aa12.51□□□□□ -0.41
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APRTP07741 180 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERGP11308 486 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MST1P26927 711 aa12.51□□□□□ -0.41
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCOLCEQ15113 449 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HKDC1Q2TB90 917 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCID2Q5JVF3 399 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSL3PQ5NE16 218 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTFR2Q6P444 385 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM207Q6UWW9 146 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.51□□□□□ -0.41
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRUNE1Q86TP1 453 aa12.51□□□□□ -0.41
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGIF2Q9GZN2 237 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TREX1Q9NSU2 369 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC14L3Q9UDX4 400 aa12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RQJ8 604 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf72A6NCS6 295 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5H15A6NDH6 313 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL21O00585 134 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MATN4O95460 622 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA5P08758 320 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGAMP11215 1152 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETS1P14921 441 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5DP30049 168 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBX1Q14549 363 aa12.5□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
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