RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 PITPNAQ00169 270 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF404Q494X3 552 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MRC1P22897 1456 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PP18 115 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ARVCFO00192 962 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC31A1O15431 190 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC6A4P31645 630 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CDKL1Q00532 357 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CREMQ03060 361 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM110Q86TL2 294 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 EBF1Q9UH73 591 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 M0QX08 132 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 WRBO00258 174 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CBLBQ13191 982 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MOGSQ13724 837 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TLL1O43897 1013 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SP3Q02447 781 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC13A2Q13183 592 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OXR1Q8N573 874 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CLDN7O95471 211 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB2AP61019 212 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TRIM2Q9C040 744 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 J3QLW9 94 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 APOL3O95236 402 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRAMEF12O95522 483 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF19P17023 458 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ITIH1P19827 911 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HSPB11Q9Y547 144 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 EDNRAP25101 427 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CEP76Q8TAP6 659 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CRELD1Q96HD1 420 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MED11Q9P086 117 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DCCP43146 1447 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RB1P06400 928 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OR12D2P58182 307 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 COQ8BQ96D53 544 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MND1Q9BWT6 205 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ISPDA4D126 451 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MANBAO00462 879 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NRP1O14786 923 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNQ1P51787 676 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FRG2Q64ET8 278 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC120Q96HB5 630 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FRG2BQ96QU4 278 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CERS4Q9HA82 394 aa14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PMM2O15305 246 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 REM1O75628 298 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GRK6P43250 576 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HSDL2Q6YN16 418 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM199Q8N511 208 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NTAN1Q96AB6 310 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DEFB118Q96PH6 123 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM129BQ96TA1 746 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MIPEPQ99797 713 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC32A1Q9H598 525 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GRB7Q14451 532 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GJD3Q8N144 294 aa14.84□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms