RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ACOX1Q15067 660 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 GALNT5Q7Z7M9 940 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SLC15A4Q8N697 577 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 OR7A2PQ8NGA2 310 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FBXL8Q96CD0 374 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 ATG10Q9H0Y0 220 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 RIBC2Q9H4K1 309 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 INMTO95050 263 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KCNK5O95279 499 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 GNRH1P01148 92 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FABP3P05413 133 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 TFPTP0C1Z6 253 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 GP2P55259 537 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KCNC3Q14003 757 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 UGT8Q16880 541 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KDM4DQ6B0I6 523 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 BCL7BQ9BQE9 202 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CEP44Q9C0F1 390 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 TPRKBQ9Y3C4 175 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 GRM6O15303 877 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SEMG1P04279 462 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FPR1P21462 350 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 KDELR2P33947 212 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 DAPP51397 102 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 IRF8Q02556 426 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 AQP6Q13520 282 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SPCS2Q15005 226 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CEP68Q76N32 757 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SPG21Q9NZD8 308 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CD84Q9UIB8 345 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 MAGEB17A8MXT2 336 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 MYO1GB0I1T2 1018 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP99D6REC4 459 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 HLA-FP30511 346 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 WNT3P56703 355 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF621Q6ZSS3 439 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 OR8J2Q8NGG1 315 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FAR1Q8WVX9 515 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 ELMO1Q92556 727 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO10Q9UK96 956 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD13-201ENST00000392539 LEFTY2O00292 366 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 XPNPEP2O43895 674 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 SCN2BO60939 215 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 COX7A2P14406 83 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 JUNDP17535 347 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 CXCR4P61073 352 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 GSTM4Q03013 218 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 HORMAD1Q86X24 394 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 VPS29Q9UBQ0 182 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 TEX28O15482 410 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 C21orf58P58505 322 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 NR1D2Q14995 579 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 DCDC5Q6ZRR9 648 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB46Q86UZ6 589 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 RASGRP3Q8IV61 690 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 RNF175Q8N4F7 328 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 STARD8Q92502 1023 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 APOL4Q9BPW4 351 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 SCN3BQ9NY72 215 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 XYLBO75191 536 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 AP2A2O94973 939 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 IL1RL1Q01638 556 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC73Q5JTD7 316 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 CBLL1Q75N03 491 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 PTOV1Q86YD1 416 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 TMC8Q8IU68 726 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 ABHD11Q8NFV4 315 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 ASZ1Q8WWH4 475 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 BBS2Q9BXC9 721 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 GMPPBQ9Y5P6 360 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 J3QRK9 145 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 hCG_2039718K7EN88 272 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 MLLT10P55197 1068 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD13-201ENST00000392539 CTF1Q16619 201 aa25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms