RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 KLHL42Q9P2K6 505 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 H0YGG7 62 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CES2O00748 559 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CRYMQ14894 314 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CSNK1A1LQ8N752 337 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CD200R1Q8TD46 325 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF480Q8WV37 535 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 DHRS7Q9Y394 339 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 HAUS5O94927 633 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ONECUT2O95948 504 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 UGT3A1Q6NUS8 523 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PCGF5Q86SE9 256 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 MIEF2Q96C03 454 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 NDNQ99608 321 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ENAMQ9NRM1 1142 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 MED16Q9Y2X0 877 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PTPN13Q12923 2485 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 MED26O95402 600 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO42Q6P3S6 717 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PAQR7Q86WK9 346 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 IQCKQ8N0W5 287 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 Q8NA96 180 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ASB11Q8WXH4 323 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 C10orf90Q96M02 699 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CDC14AQ9UNH5 594 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 E7ENX8 843 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SOCS6O14544 535 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 BANF1O75531 89 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TTC4O95801 387 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 RGS4P49798 205 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ABATP80404 500 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TAP2Q03519 686 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 BBS9Q3SYG4 887 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PALM2Q8IXS6 379 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 FLNCQ14315 2725 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 MAP2K7O14733 419 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 AGFG2O95081 481 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ANXA5P08758 320 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 KLC1Q07866 573 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 HKDC1Q2TB90 917 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 FHL5Q5TD97 284 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 KIRREL2Q6UWL6 708 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 NAT9Q9BTE0 207 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 C3orf18Q9UK00 162 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 GFYI3L273 518 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZGLP1P0C6A0 271 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ACPPP15309 386 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 SOX8P57073 446 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF425Q6IV72 752 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-202ENST00000378546 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms