RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP5CP53041 499 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MC1RQ01726 317 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEAL1Q15170 157 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PAQR7Q86WK9 346 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TIGD4Q8IY51 512 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 THAP6Q8TBB0 222 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 M0R036 132 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AMD1P17707 334 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GSTM3P21266 225 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP2K3P46734 347 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 USP41Q3LFD5 358 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKFN1Q8N957 763 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5J2Q8NH18 312 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNA7Q96RP8 456 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPAN1O60635 241 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MT-ND2P03891 347 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HLA-DQB2P05538 268 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CD52P31358 61 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NSG1P42857 185 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PMS2P3Q13401 168 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2L5Q8NG80 312 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2L3Q8NG85 312 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RIPK3Q9Y572 518 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ITGA10O75578 1167 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR6K6Q8NGW6 343 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 COQ8AQ8NI60 647 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NCSTNQ92542 709 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ARL6IP5O75915 188 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LILRA4P59901 499 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OLIG2Q13516 323 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SEMA3AQ14563 771 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PIGGQ5H8A4 983 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR52E8Q6IFG1 317 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 POMZP3Q6PJE2 187 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CDC7O00311 574 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DSTNP60981 165 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DUSP4Q13115 394 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPEARQ8WU66 669 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SACM1LQ9NTJ5 587 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SOHLH2Q9NX45 425 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SOCS2O14508 198 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ENPP3O14638 875 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR7A10O76100 309 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ANXA3P12429 323 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KHKP50053 298 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJB13P59910 316 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 IQCHQ86VS3 1027 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PYCR2Q96C36 320 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AIFM2Q9BRQ8 373 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C3P01024 1663 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A1W2PQ67 120 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR1I1O60431 355 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HPRP00739 348 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CSN2P05814 226 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NT5EP21589 574 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FNTBP49356 437 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DIO3P55073 304 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TOMM20Q15388 145 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KBTBD6Q86V97 674 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TRIM36Q9NQ86 728 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NFAT5O94916 1531 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PPEF2O14830 753 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OAS1P00973 400 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CTSEP14091 401 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LHCGRP22888 699 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PROZP22891 400 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms