RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339711.8

PRDM8-201, Transcript of PR/SET domain 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM8, Length 4,095 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8-201ENST00000339711 FOXM1Q08050 763 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 GRIK2Q13002 908 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TP53BP2Q13625 1128 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF423Q2M1K9 1284 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CASP12Q6UXS9 341 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TMC8Q8IU68 726 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 GALNT13Q8IUC8 556 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CAPN3P20807 821 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 HOXA9P31269 272 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 IHHQ14623 411 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PDSS2Q86YH6 399 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ABHD8Q96I13 439 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TMEM165Q9HC07 324 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 FBXL12Q9NXK8 326 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ISM1B1AKI9 464 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 OLFM2O95897 454 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 IFNA14P01570 189 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 C6P13671 934 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ACP5P13686 325 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 POU2F1P14859 743 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 NCF4Q15080 339 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLC15A3Q8IY34 581 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 HTRA1Q92743 480 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 C1SP09871 688 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 UMPSP11172 480 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PRPS1L1P21108 318 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 KELP23276 732 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLC6A11P48066 632 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PSMD7P51665 324 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 MS4A2Q01362 244 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 C2orf80Q0P641 193 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 MED22Q15528 200 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 LIPIQ6XZB0 460 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 OOSP2Q86WS3 158 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SLC16A5O15375 505 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 LAPTM4AQ15012 233 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 INAQ16352 499 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 XKR5Q6UX68 686 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 AHSA2Q719I0 299 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 FLCNQ8NFG4 579 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 WASH3PC4AMC7 463 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 FZD6O60353 706 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PCSK2P16519 638 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 GPX3P22352 226 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 LHCGRP22888 699 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 TGM3Q08188 693 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 LAPTM5Q13571 262 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 NANOGP8Q6NSW7 305 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 MTSS1LQ765P7 747 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 NANOGQ9H9S0 305 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 VPS4AQ9UN37 437 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 E2F3O00716 465 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CLCNKAP51800 687 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF234Q14588 700 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 CHSY3Q70JA7 882 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 C12orf66Q96MD2 445 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 BBS4Q96RK4 519 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 EHD3Q9NZN3 535 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 IRAK3Q9Y616 596 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM8-201ENST00000339711 J3QRK9 145 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms