RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SHISA7A6NL88 538 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DFNA5O60443 496 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 STAMBPO95630 424 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACADMP11310 421 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFV2P19404 249 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ATG9BQ674R7 924 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SPPL2CQ8IUH8 684 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 WDR34Q96EX3 536 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 BRF2Q9HAW0 419 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SCAMP1O15126 338 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ECSITQ9BQ95 431 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SUFUQ9UMX1 484 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 AP4S1Q9Y587 144 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF839A8K0R7 811 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PI15O43692 258 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 HSD3B1P14060 373 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACPPP15309 386 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 HSD3B2P26439 372 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACSL1P33121 698 aa21.97■■□□□ 1.11
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VSTM4-201ENST00000298454 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DMPKQ09013 629 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SPATS1Q496A3 300 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 USP30Q70CQ3 517 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 RIMKLAQ8IXN7 391 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ZUFSPQ96AP4 578 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.97■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PIPSLA2A3N6 862 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 POM121BA6NF01 834 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ARPC2O15144 300 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 B3GALT4O96024 378 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN2P57739 230 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SFT2D3Q587I9 215 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SYT12Q8IV01 421 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MENTQ9BUN1 341 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB11Q9BUY7 163 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.96■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MBTPS2O43462 519 aa21.95■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 ERGP11308 486 aa21.95■■□□□ 1.1
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VSTM4-201ENST00000298454 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 ACSM2AQ08AH3 577 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PGS1Q32NB8 556 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PYCR3Q53H96 274 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CMPK2Q5EBM0 449 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 ACSM2BQ68CK6 577 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 LCN8Q6JVE9 175 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf66Q96MD2 445 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 EHD1Q9H4M9 534 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL33A6NCF5 533 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP10O43572 662 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 S100A3P33764 101 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CCINQ13939 588 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 FAM110BQ8TC76 370 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 FAM3CQ92520 227 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 TESCQ96BS2 214 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 TIMM29Q9BSF4 260 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A13Q9NSD5 602 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 CDH1P12830 882 aa21.94■■□□□ 1.1
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A1P30825 629 aa21.94■■□□□ 1.1
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