RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LMO7DNF2Z398 122 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VIPP01282 170 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GIMD1P0DJR0 217 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB28P51157 221 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP4BP51164 291 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICE2Q659A1 982 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX32Q86XE0 403 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEIL2Q969S2 332 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPHK1Q9NYA1 384 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA7Q9P0W8 599 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTRCQ9Y297 605 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCM1Q15154 2024 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOBOXO60393 691 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LINC00032P0C843 101 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL6Q6IPX3 200 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCIMPQ6UWF3 145 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LCN9Q8WX39 176 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEAL3Q969E4 200 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0G2JNG1 304 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANXA6P08133 673 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYF5P13349 255 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD22P20273 847 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CUL3Q13618 768 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIR2DS5Q14953 304 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CATSPEREQ5SY80 951 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAC3Q9UHF0 121 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDH15Q96QU1 1955 aa23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FFAR3O14843 346 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR42O15529 346 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPN1P07384 714 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LBPP18428 481 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFS1P28331 727 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RXRGP48443 463 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTR6P50406 440 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAP1GDS1P52306 607 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC25A3Q00325 362 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HHEXQ03014 270 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCL1Q15111 1095 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARL14Q8N4G2 192 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2L8Q8NGY9 312 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HBEGFQ99075 208 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTMT1Q9BV86 223 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAREM1Q9H706 876 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTR8Q9H981 624 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POT1Q9NUX5 634 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5K4A6NMS3 321 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTN3A3O00478 584 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPM1DO15297 605 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD1EP15812 388 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MPLP40238 635 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHIT1Q13231 466 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XKR7Q5GH72 579 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL6Q8TCB7 284 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THTPAQ9BU02 230 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPEGQ15772 3267 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1B0GTQ1 180 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMPRSS11BQ86T26 416 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOMEZQ8IX15 550 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KYQ8NBH2 561 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMPDL3AQ92484 453 aa23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITGAXP20702 1163 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCND1P24385 295 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXD12P35452 270 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DOC2AQ14183 400 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAPRE2Q15555 327 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XKR6Q5GH73 641 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms