RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265245.9

LSG1-201, Transcript of large 60S subunit nuclear export GTPase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSG1, Length 3,572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1-201ENST00000265245 EBPLQ9BY08 206 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 FANCEQ9HB96 536 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 VPS29Q9UBQ0 182 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 U3KQV3 271 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 SERTM1A2A2V5 107 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 KRT87PA6NCN2 255 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 TMEM247A6NEH6 219 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ABCB7O75027 752 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 MYO1DO94832 1006 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 EPN2O95208 641 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GSTM1P09488 218 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GSTT2P0CG29 244 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GSTT2BP0CG30 244 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 COX7A2P14406 83 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GZMMP51124 257 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ARHGDIAP52565 204 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 PFN3P60673 137 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GSTM4Q03013 218 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ACSM2AQ08AH3 577 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ABRQ12979 859 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 SPIDRQ14159 915 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 DUOXA1Q1HG43 343 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ACSM2BQ68CK6 577 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 SERPINA11Q86U17 422 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 C10orf111Q8N326 155 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CDC26Q8NHZ8 85 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CCDC138Q96M89 665 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 MBOAT4Q96T53 435 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 BAG5Q9UL15 447 aa10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 PRAMEF4O60810 478 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ATE1O95260 518 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 B3GALT4O96024 378 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 IL7RP16871 459 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ETV3P41162 512 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CCR2P41597 374 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 MTAPQ13126 283 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 FPGTO14772 594 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.99□□□□□ -0.81
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LSG1-201ENST00000265245 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 TDP1Q9NUW8 608 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 A0A1W2PPW3 197 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 PRKACGP22612 351 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LSG1-201ENST00000265245 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.99□□□□□ -0.81
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