RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 TMEM198Q66K66 360 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 TRIM46Q7Z4K8 759 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ARL14Q8N4G2 192 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CEP76Q8TAP6 659 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 FRG2BQ96QU4 278 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ELOVL6Q9H5J4 265 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SAR1AQ9NR31 198 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CCL27Q9Y4X3 112 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa21.86■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CFIP05156 583 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PRR35P0CG20 571 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 FASLGP48023 281 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 NEK2P51955 445 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 FAM129CQ86XR2 697 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 AVL9Q8NBF6 648 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PELI2Q9HAT8 420 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CAPN10Q9HC96 672 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 LAPTM5Q13571 262 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 LPAL2Q16609 132 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CHSY3Q70JA7 882 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.85■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 A0A1B0GTQ1 180 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SERTM1A2A2V5 107 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ISM1B1AKI9 464 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PATE3B3GLJ2 98 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SLC28A1O00337 649 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PPM1DO15297 605 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 GIMD1P0DJR0 217 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 HLA-BQ31612 363 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 MED27Q6P2C8 311 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 GPR156Q8NFN8 814 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 OR2L3Q8NG85 312 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 OR7G3Q8NG95 312 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ARMCX1Q9P291 453 aa21.84■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PIPSLA2A3N6 862 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 OR6C74A6NCV1 312 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PEX11AO75192 247 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 LBPP18428 481 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ZNF33BQ06732 778 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 KIR2DS3Q14952 304 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 LAS2Q8IYD9 372 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 MARK4Q96L34 752 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CATSPER2Q96P56 530 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UFD1-201ENST00000263202 PRR33A8MZF0 331 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 H7BY64 318 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 LSM1O15116 133 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 RGS14O43566 566 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 UBOX5O94941 541 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 CCR8P51685 355 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ABATP80404 500 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 ACPTQ9BZG2 426 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 UCK1Q9HA47 277 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 UBDO15205 165 aa21.82■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 CCNDBP1O95273 360 aa21.82■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 NUBP1P53384 320 aa21.82■■□□□ 1.08
UFD1-201ENST00000263202 HMGCS1Q01581 520 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms