RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 H0YGG7 62 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.811e-7■□□□□ 8.7
NEDD8-201ENST00000250495 NRP2O60462 931 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 USP1O94782 785 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 CCNDBP1O95273 360 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 MED26O95402 600 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 KRT14P02533 472 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 MLNP12872 115 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 PRTGQ2VWP7 1150 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 MVB12AQ96EY5 273 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 CABS1Q96KC9 395 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 LMF1Q96S06 567 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 C3orf18Q9UK00 162 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.08■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 WIPF3A6NGB9 483 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MAP2K7O14733 419 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 HPP00738 406 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RNF224P0DH78 156 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ACPPP15309 386 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CLCN7P51798 805 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PNLIPRP1P54315 467 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PAQR7Q86WK9 346 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf90Q96M02 699 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PKP4Q99569 1192 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TXNDC9O14530 226 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CXCR2P25025 360 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ABATP80404 500 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RELAQ04206 551 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TLR1Q15399 786 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 VWA2Q5GFL6 755 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ICE2Q659A1 982 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ATG9BQ674R7 924 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MCUQ8NE86 351 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 C5orf34Q96MH7 638 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 A1L4Q6 167 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB14O43829 449 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NRDCO43847 1150 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LDLRP01130 860 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MPC1LP0DKB6 136 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 EMP2P54851 167 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 Q0VFX4 171 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 DSG2Q14126 1118 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 KCNJ9Q92806 393 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CNDP1Q96KN2 507 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TAC3Q9UHF0 121 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 POLEQ07864 2286 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 E7ENX8 843 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PCDH17O14917 1159 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 SLC16A8O95907 504 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ANXA5P08758 320 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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