RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ISL2Q96A47 359 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DPY30Q9C005 99 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 FZD10Q9ULW2 581 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ISM1B1AKI9 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PDPK1O15530 556 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CREG1O75629 220 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SOX14O95416 240 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF45Q02386 682 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 NELL1Q92832 810 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 NANSQ9NR45 359 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 FABP7O15540 132 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 UMPSP11172 480 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GPR15P49685 360 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 WNT3AP56704 352 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GBX1Q14549 363 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MARC2Q969Z3 335 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF583Q96ND8 569 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ING3Q9NXR8 418 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CACNA1CQ13936 2221 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 A0A087X1B8 175 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 H0YC42 278 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GFRA2O00451 464 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ENPEPQ07075 957 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PSMD5Q16401 504 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TMCO6Q96DC7 493 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CCDC126Q96EE4 140 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TRIM64BA6NI03 449 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TGFBR2P37173 567 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GRIK1P39086 918 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGAP1Q07960 439 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KCNA10Q16322 511 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RAET1EQ8TD07 263 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MAL2Q969L2 176 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PCED1BQ96HM7 432 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 HMX3A6NHT5 357 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KELP23276 732 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PPP3CCP48454 512 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 UGT2B15P54855 530 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DSC2Q02487 901 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SLC51BQ86UW2 128 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SLC39A13Q96H72 371 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ART5Q96L15 291 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 REEP1Q9H902 201 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 A0A1W2PRG6 482 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 NCR1O76036 304 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms