RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Smyd4Q8BTK5 799 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 BC024139Q8BVJ3 772 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tgif2Q8C0Y1 237 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lrif1Q8CDD9 755 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Panx3Q8CEG0 392 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lars2Q8VDC0 902 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Aldh6a1Q9EQ20 535 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Hipk3Q9ERH7 1192 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wfdc1Q9ESH5 211 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ate1Q9Z2A5 516 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa7.33□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Itih4A6X935 942 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Akirin2B1AXD8 201 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Enthd1E9Q1Z2 618 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm17175E9Q528 179 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr596F8VQ26 312 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc6a6O35316 621 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc2a7P0C6A1 513 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 LynP25911 512 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tnfrsf4P47741 272 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm1587Q3UT80 123 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trcg1Q58Y74 825 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Otop2Q80SX5 563 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Acot4Q8BWN8 421 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Commd2Q8BXC6 199 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr586Q8VH13 317 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Nt5c1bQ91YE9 573 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Q9CWU4 180 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cldn9Q9Z0S7 217 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cpxm1Q9Z100 722 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bscl2Q9Z2E9 383 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cacna1sQ02789 1880 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Col22a1E9Q7P1 1613 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 TomtA1Y9I9 258 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ttc39aA2ACP1 578 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tcte1A6H639 498 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn1r88E9Q235 316 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm20503G3UZK1 150 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm6882J3KMT3 313 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm10338K7N692 204 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 NoctO35710 429 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rad51dO55230 329 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fgf1P61148 155 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Adra1bP97717 514 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm10662Q3UT86 313 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Defa17Q64016 82 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dusp23Q6NT99 150 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Scube1Q6NZL8 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc39a10Q6P5F6 833 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr533Q7TRT7 320 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr384Q7TRX8 312 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Lrrc19Q8BZT5 364 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bbs4Q8C1Z7 520 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1361Q8VFH0 317 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cryl1Q99KP3 319 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cby1Q9D1C2 127 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rad21l1A2AU37 552 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1188A2AV10 312 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Bcl2a1dO55179 172 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ccr3P51678 359 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Wdr5P61965 334 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 ElocP83940 112 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmem184cQ3TPR7 525 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cd6Q61003 665 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Prkg2Q61410 762 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Doxl2Q6IMK7 723 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 ManeaQ6NXH2 462 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmc6Q7TN60 810 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 MroQ7TNB4 248 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Snx32Q80ZJ7 404 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zfand1Q8BFR6 268 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fam131aQ8BWU3 361 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ing4Q8C0D7 249 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Zmiz2Q8CIE2 920 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Slc5a9Q8VDT1 685 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Olfr1122Q8VGT9 326 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Trem2Q99NH8 227 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Izumo2Q9DA16 220 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Tmbim4Q9DA39 238 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ndst3Q9EQH7 873 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Spo11Q9WTK8 396 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Spata31d1aE9QA35 1336 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 C6E9Q6D8 931 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 SgceO70258 437 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Grpel2O88396 224 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Stfa3P35173 103 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 TtlP38585 377 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gata5P97489 404 aa7.32□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Msx2Q03358 267 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.2 ms