RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641746.1

CASC19-256, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 958 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-256	ENST00000641746	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	RAD23A	P54725	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	LGALS4	P56470	323 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	RAB1A	P62820	205 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CSNK1G2	P78368	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	HTD2	P86397	168 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FOLH1	Q04609	750 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CD69	Q07108	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	STK4	Q13043	487 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	GPS2	Q13227	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	AMZ1	Q400G9	498 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	STK40	Q8N2I9	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	SUN5	Q8TC36	379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	KIFAP3	Q92845	792 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	PCED1B	Q96HM7	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	SH3GL1	Q99961	368 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	SYT15	Q9BQS2	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	DCLK3	Q9C098	648 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CLPB	Q9H078	707 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ING2	Q9H160	280 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	IL25	Q9H293	177 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CTAGE9	A4FU28	777 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746		A6NL46	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	IKBKB	O14920	756 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	SLC16A4	O15374	487 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CEP104	O60308	925 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CREG1	O75629	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	STK17B	O94768	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CPNE6	O95741	557 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	HMBS	P08397	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	KEL	P23276	732 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ABCD3	P28288	659 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	AKT1	P31749	480 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	THOP1	P52888	689 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CDK17	Q00537	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FMO1	Q01740	532 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CUL4B	Q13620	913 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZNF235	Q14590	738 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CRYM	Q14894	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	BOLA3	Q53S33	107 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	XKRX	Q6PP77	449 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	PXK	Q7Z7A4	578 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	KIAA1328	Q86T90	577 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	SFR1	Q86XK3	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	HPS6	Q86YV9	775 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	CD302	Q8IX05	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	TTC39C	Q8N584	583 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	ANKRD7	Q92527	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	RTP4	Q96DX8	246 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CASC19-256	ENST00000641746	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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