RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC30A4O14863 429 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PRKCGP05129 697 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACP5P13686 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FDXRP22570 491 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAB25P57735 213 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LIN52Q52LA3 116 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IGSF8Q969P0 613 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SYT11Q9BT88 431 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ABI3Q9P2A4 366 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MYADML2A6NDP7 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ13O60928 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SCN2BO60939 215 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 STC2O76061 302 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HNF1BP35680 557 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OMPP47874 163 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MERTKQ12866 999 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC13A2Q13183 592 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NEMP2A6NFY4 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN14A8MX76 684 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CASKO14936 926 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NBNO60934 754 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RHOP08100 348 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 BICRALQ6AI39 1079 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 USP43Q70EL4 1123 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MCFD2Q8NI22 146 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LRCH3Q96II8 777 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PGRMC2O15173 223 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEB3O15480 346 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MMP20O60882 483 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GJB5O95377 273 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 H6PDO95479 791 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA3P01011 423 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ALAS2P22557 587 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ABHD18Q0P651 414 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GRIK2Q13002 908 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PYURFQ96I23 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CLDND1Q9NY35 253 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SHMT2P34897 504 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR1BP42025 376 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GRK6P43250 576 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms