RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVR1CQ8NER5 493 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAS4Q8TDM0 211 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 LPGAT1Q92604 370 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 IL26Q9NPH9 171 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL8A6PVC2 850 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 VEGFDO43915 354 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS4BO75351 444 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFS3O75489 264 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK14O94921 469 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 DRD4P21917 467 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CA5AP35218 305 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB3Q13509 450 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA3AQ14563 771 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF789Q5FWF6 425 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX20Q7Z614 316 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS35Q96QK1 796 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MID2Q9UJV3 735 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS4AQ9UN37 437 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 AGFG2O95081 481 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 IDSP22304 550 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN4P29074 926 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAM1P38567 509 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FHL5Q5TD97 284 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH11Q8N954 259 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GDAP1Q8TB36 358 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RDH11Q8TC12 318 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR87Q9BY21 358 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CAB39LQ9H9S4 337 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 RARRES3Q9UL19 164 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC189A1A4V9 331 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A1P02730 911 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PROCP04070 461 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 EBLN1P0CF75 366 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGALP20701 1170 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPH1Q70E73 1250 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SSC4DQ8WTU2 575 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K3Q99759 626 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE7BQ9NP56 450 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 EMCNQ9ULC0 261 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LRBAP50851 2863 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK5Q92824 1860 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL2O95198 593 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ESR1P03372 595 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 BPGMP07738 259 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FDXRP22570 491 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.328e-7■■■■□ 23
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP97Q8IW35 865 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8NA96 180 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP4Q8WY91 577 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MANSC1Q9H8J5 431 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAB1O14561 156 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CEACAM4O75871 244 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSCP53634 463 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 DMPKQ09013 629 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RPE65Q16518 533 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGWQ7Z7B1 504 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SYVN1Q86TM6 617 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 D2HGDHQ8N465 521 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.3■■□□□ 1.32
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