RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 PEX12O00623 359 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 MED26O95402 600 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 IVDP26440 423 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 HSD17B2P37059 387 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 CUL1Q13616 776 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 NKG7Q16617 165 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 HPS6Q86YV9 775 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 NACC2Q96BF6 587 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR21Q99679 349 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR54Q9H977 334 aa22.53■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 HYKKA2RU49 373 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC16A8O95907 504 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 IGHEP01854 428 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 PGAM1P18669 254 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 PNLIPRP1P54315 467 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 MPP1Q00013 466 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 PTK6Q13882 451 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 MSS51Q4VC12 460 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNMB4Q86W47 210 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 CD200R1Q8TD46 325 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF480Q8WV37 535 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 SPSB2Q99619 263 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.52■■□□□ 1.2
PPP1CC-211ENST00000620030 FLNCQ14315 2725 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 USP27XA6NNY8 438 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 TTLL8A6PVC2 850 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 E7ENX8 843 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MASP2O00187 686 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 DPM1O60762 260 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MMP11P24347 488 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 OR1D4P47884 311 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 SOX8P57073 446 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 TAP2Q03519 686 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CRYMQ14894 314 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 NAA25Q14CX7 972 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PCGF5Q86SE9 256 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PAQR7Q86WK9 346 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 C5AR2Q9P296 337 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.51■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 BANF1O75531 89 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVK-10P10266 1014 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 GABRB3P28472 473 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RAPSNQ13702 412 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF425Q6IV72 752 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 GALNT16Q8N428 558 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF839A8K0R7 811 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 H0YGG7 62 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 AGPSO00116 658 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB14O43829 449 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC4O95801 387 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 EMP3P54852 163 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RELAQ04206 551 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 MYBPC3Q14896 1274 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ICE2Q659A1 982 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CREG2Q8IUH2 290 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PPP1CC-211ENST00000620030 Q8NA96 180 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms