RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSD3B1P14060 373 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 JUPP14923 745 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSD3B2P26439 372 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 IMPA1P29218 277 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLDN2P57739 230 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDH1Q08174 1060 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAA25Q14CX7 972 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP2A13Q16696 494 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 XKR7Q5GH72 579 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 Q6ZSR6 202 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMPDL3AQ92484 453 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PYCR2Q96C36 320 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK15Q96Q40 435 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB18Q99592 522 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 EHD1Q9H4M9 534 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 GULP1Q9UBP9 304 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASB1Q9Y576 335 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1W2PPC4 97 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PEX11AO75192 247 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP6AP2O75787 350 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO1DO94832 1006 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT16P08779 473 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXA1P55317 472 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 EMX2Q04743 252 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ART3Q13508 389 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 LCTLQ6UWM7 567 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASRGL1Q7L266 308 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT78Q8N1N4 520 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPEARQ8WU66 669 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF480Q8WV37 535 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIGKQ92643 395 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 BMFQ96LC9 184 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNK6Q9Y257 313 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERTM1A2A2V5 107 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5K4A6NMS3 321 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEI4A8MW99 385 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FFAR3O14843 346 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR42O15529 346 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CIB2O75838 187 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCNDBP1O95273 360 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 T-ENOLP0DO92 83 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTSEP14091 401 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CASP2P42575 452 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBPL1P62380 186 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CUL3Q13618 768 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGKQ53H12 422 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FRG2Q64ET8 278 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TREML1Q86YW5 311 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 AVL9Q8NBF6 648 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 BIRC7Q96CA5 298 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms