RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LCHNA4D1U4 455 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FABP12A6NFH5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BTN3A3O00478 584 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GABRDO14764 452 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ANKRD28O15084 1053 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SH3BP5O60239 455 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RAMP2O60895 175 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 OR2B3O76000 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TBX18O95935 607 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 KRT6AP02538 564 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 C1QCP02747 245 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 KRT6BP04259 564 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SERPINF2P08697 491 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 OR4Q2P0C623 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FPR1P21462 350 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RRM2P31350 389 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ACVRL1P37023 503 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PIK3CBP42338 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BRCC3P46736 316 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 HK3P52790 923 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MAPK12P53778 367 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TWF1Q12792 350 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BAK1Q16611 211 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 Q5BKY6 102 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 LAX1Q8IWV1 398 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 OR8H3Q8N146 312 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DPP10Q8N608 796 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SPERTQ8NA61 448 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FEVQ99581 238 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MGLLQ99685 303 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 BTBD2Q9BX70 525 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SNX7Q9UNH6 387 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CFL2Q9Y281 166 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.49□□□□□ -1.37
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LMO3-235ENST00000616247 DPEP1P16444 411 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 MC4RP32245 332 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SOX3P41225 446 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 RGS6P49758 472 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PGFP49763 221 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CDH12P55289 794 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CHRNEQ04844 493 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PRKCDQ05655 676 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GRIK2Q13002 908 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GPAT3Q53EU6 434 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 NLRP8Q86W28 1048 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TAGAPQ8N103 731 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 GGHQ92820 318 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 TP53INP1Q96A56 240 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 EGLN2Q96KS0 407 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 FRMD6Q96NE9 622 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DERL2Q9GZP9 239 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-235ENST00000616247 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.49□□□□□ -1.37
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