RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NRTN	Q99748	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ATM	Q13315	3056 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995		E5RI56	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NDC80	O14777	642 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KPNA5	O15131	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TP73	O15350	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PAX4	O43316	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HAUS5	O94927	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TTC4	O95801	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CAPNS1	P04632	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CHRM3	P20309	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AOAH	P28039	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ACADL	P28330	430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NDUFS1	P28331	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC5A2	P31639	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GDNF	P39905	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ABCG1	P45844	678 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CD151	P48509	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PLTP	P55058	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EGR3	Q06889	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FOXM1	Q08050	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRADD	Q15628	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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