RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR39O43194 453 aa11.2□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS26AO75436 327 aa11.2□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 AP2A2O94973 939 aa11.2□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QAP02745 245 aa11.2□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAR1Q8WVX9 515 aa11.2□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 FTH1P02794 183 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 GPR3P46089 330 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 VWA7Q9Y334 891 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 AKAP6Q13023 2319 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 INAFM1C9JVW0 142 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 KPNA5O15131 536 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CLDN14O95500 239 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SOD1P00441 154 aa11.18□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF28P17035 718 aa11.18□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 CUZD1Q86UP6 607 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNJ9Q92806 393 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.18□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 SH3GL2Q99962 352 aa11.18□□□□□ -0.62
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