RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 AMIGO1Q86WK6 493 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf64Q86WR6 236 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC37A2Q8TED4 501 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R36Q96LQ0 422 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YIV9 168 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP76Q8TAP6 659 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 ERP27Q96DN0 273 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PELI2Q9HAT8 420 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM74BQ9NUR3 256 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MANBAO00462 879 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 NXPE4Q6UWF7 544 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM46Q7Z4K8 759 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CLNKQ7Z7G1 428 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS11BQ86T26 416 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A18Q96BI1 424 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 TWSG1Q9GZX9 223 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC28A1O00337 649 aa29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00032P0C843 101 aa29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2E3Q969T4 207 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf30Q96M34 536 aa29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PBE3 544 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 FFAR3O14843 346 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR42O15529 346 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 FRG2BQ96QU4 278 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 XKR8Q9H6D3 395 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD11Q8NFV4 315 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOMQ8WWX9 145 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-206ENST00000588815 B4DGG1 531 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A2O15244 555 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD3B1P14060 373 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 HRH2P25021 359 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD3B2P26439 372 aa29.93■■■□□ 2.38
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