RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 FRG2Q64ET8 278 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ATG9BQ674R7 924 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PMS2CLQ68D20 193 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PATE1Q8WXA2 126 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 FRG2BQ96QU4 278 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TAC3Q9UHF0 121 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 LSM1O15116 133 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX11AO75192 247 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SCTRP47872 440 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 YBX1P67809 324 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NAGSQ8N159 534 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 DTWD2Q8NBA8 298 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR20Q8TBZ3 569 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ACAT2Q9BWD1 397 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.13■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SERTM1A2A2V5 107 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD65E5RJM6 399 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC22A2O15244 555 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMB5P28074 263 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NCALDP61601 193 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SGO1Q5FBB7 561 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NXPE4Q6UWF7 544 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SFTPA2Q8IWL1 248 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SELENOMQ8WWX9 145 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NSL1Q96IY1 281 aa25.12■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC28A1O00337 649 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM1AO60341 852 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NEK2P51955 445 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 LYSMD4Q5XG99 296 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf74Q86VG3 221 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ACPTQ9BZG2 426 aa25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0G2JNG1 304 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 OR5K4A6NMS3 321 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR2DS3K7RE56 304 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CDH1P12830 882 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CD1EP15812 388 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF33BQ06732 778 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR2DS5Q14953 304 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NAA25Q14CX7 972 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 POT1Q9NUX5 634 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 RGS14O43566 566 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR37L1O60883 481 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP5HO75947 161 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3R1P27986 724 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SHMT2P34897 504 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP4BP51164 291 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVK-8P63133 956 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGCS1Q01581 520 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SQLEQ14534 574 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ELOCQ15369 112 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NR6A1Q15406 480 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 C17orf64Q86WR6 236 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM129CQ86XR2 697 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC37A2Q8TED4 501 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFPM2Q8WW38 1151 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 LCN9Q8WX39 176 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SPNS1Q9H2V7 528 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 MRGBPQ9NV56 204 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 OR6C2Q9NZP2 312 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CPNE7Q9UBL6 633 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 TAGLN3Q9UI15 199 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.1■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 HRO43593 1189 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CALB2P22676 271 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PLK5Q496M5 336 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 AMIGO1Q86WK6 493 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 OR7G3Q8NG95 312 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 NELL1Q92832 810 aa25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SCAMP4-210ENST00000588555 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms