RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	KATNA1	O75449	491 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSPAN12	O95859	305 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGXT	P21549	392 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMB5	P28074	263 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CMPK1	P30085	196 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	GCGR	P47871	477 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAP2	Q03519	686 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RELA	Q04206	551 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	DLG3	Q92796	817 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	OLFM1	Q99784	485 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MIPEP	Q99797	713 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTSV	O60911	334 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAPN1	P07384	714 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD63	P08962	238 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	IMPA1	P29218	277 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSTR1	P30872	391 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARSF	P54793	590 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABAT	P80404	500 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRADD	Q15628	312 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDKL2	Q92772	493 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ONECUT2	O95948	504 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTSB	P07858	339 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAGEA4	P43358	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCR10	P46092	362 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRM7	Q14831	915 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	NCF4	Q15080	339 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGT8	Q16880	541 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ICE2	Q659A1	982 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	CPNE1	Q99829	537 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.07	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms