RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEMA3GQ9NS98 782 aa26.97■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.97■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MATN4O95460 622 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERVK-10P10266 1014 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 YBX1P67809 324 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GBX1Q14549 363 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NAA25Q14CX7 972 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HIF1AQ16665 826 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CUZD1Q86UP6 607 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4N4Q8N0Y3 316 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM58Q8NG06 486 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR9A1PQ8NGU1 263 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VPS50Q96JG6 964 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGAP4Q96P64 663 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DPH7Q9BTV6 452 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CRB3Q9BUF7 120 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CSAG2Q9Y5P2 127 aa26.96■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A1L4Q6 167 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VSTM2BA6NLU5 285 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 E5RI56 91 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AVILO75366 819 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MED26O95402 600 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CBX6O95503 412 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDAH2O95865 285 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAMP19021 973 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OGNP20774 298 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADARP55265 1226 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OCA2Q04671 838 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRSS58Q8IYP2 241 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GALPQ9UBC7 116 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX15Q9BXT5 2789 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UNC79Q9P2D8 2635 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2A25A4D2G3 310 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGEF33A8MVX0 844 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPS1Q13098 491 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNJ11Q14654 390 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRMT9Q6P2P2 845 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SUSD1Q6UWL2 747 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRELID2Q8N945 189 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR11G2Q8NGC1 345 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STT3BQ8TCJ2 826 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP4R1Q8TF05 950 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMPDL3AQ92484 453 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIEF2Q96C03 454 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LHPPQ9H008 270 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM114A2Q9NRY5 505 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOTCH2Q04721 2471 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKUB1A6NFN9 424 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PKMP14618 531 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARSP49589 748 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLC1Q07866 573 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MUM1Q2TAK8 710 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CRB2Q5IJ48 1285 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NEPROQ6NW34 567 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CENPUQ71F23 418 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CABS1Q96KC9 395 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NTNG1Q9Y2I2 539 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VPS26AO75436 327 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CATP04040 527 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZGLP1P0C6A0 271 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERGP11308 486 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FBLP22087 321 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C10orf90Q96M02 699 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EPS8L2Q9H6S3 715 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 H0YGG7 62 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYO1CO00159 1063 aa26.91■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms