RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL12AP29459 219 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LAPTM5Q13571 262 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP2A13Q16696 494 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2M4Q96R27 311 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LPCAT2Q7L5N7 544 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 MINDY1Q8N5J2 469 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 FERD3LQ96RJ6 166 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CTBSQ01459 385 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCBD2Q9H0N5 130 aa28.15■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AAGABQ6PD74 315 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 NXPE4Q6UWF7 544 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q7L0L9 218 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR7G3Q8NG95 312 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS33AQ96AX1 596 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS29Q9UBQ0 182 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC45A3Q96JT2 553 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 MVB12BQ9H7P6 319 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGR1Q14914 329 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RCN1Q15293 331 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0895LQ68EN5 471 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 H0Y8X5 98 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa28.11■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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