RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF44Q7L0R7 432 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB43Q86YS6 212 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALM2Q8IXS6 379 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF480Q8WV37 535 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP10Q96AY3 582 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD17AQ96GS6 310 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDNQ99608 321 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERP44Q9BS26 406 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WHRNQ9P202 907 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 E7ENX8 843 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DSCR3O14972 297 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC28A2O43868 658 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSVO60911 334 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ONECUT2O95948 504 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAP2Q03519 686 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MGAT5Q09328 741 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf189Q5VU69 101 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ICE2Q659A1 982 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PWWP2AQ96N64 755 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPH7Q9BTV6 452 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFATQ9P243 1243 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX24Q9Y343 169 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.38■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUV39H1O43463 412 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WISP1O95388 367 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHEP01854 428 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALBP02768 609 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTSBP07858 339 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRH2P25021 359 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOLR3P41439 243 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 EMP3P54852 163 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRADP55042 308 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDKN2DP55273 166 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL2P60568 153 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSPNQ14714 243 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLIPQ5VWP3 458 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED25Q71SY5 747 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NACC2Q96BF6 587 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC138Q96M89 665 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR54Q9H977 334 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARVBQ9HBI1 364 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUTCQ9NTM9 273 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAC3Q9UHF0 121 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 VWA7Q9Y334 891 aa16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALAS2P22557 587 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FDXRP22570 491 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCND1P24385 295 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 IMPA1P29218 277 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFKB2Q00653 900 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAV1Q03135 178 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF425Q6IV72 752 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms