RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	EPN2	O95208	641 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	AGXT	P21549	392 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LHCGR	P22888	699 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HAL	P42357	657 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK10	P53779	464 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CCL23	P55773	120 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CXCR4	P61073	352 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	IL5RA	Q01344	420 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ACOX1	Q15067	660 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SGCD	Q92629	289 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PANX1	Q96RD7	426 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CEP44	Q9C0F1	390 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		17.88	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OBSL1	O75147	1896 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PTGES3L	E9PB15	166 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC1	O00299	241 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FPGT	O14772	594 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LRAT	O95237	230 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPTL1	O95841	491 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	17.87	■□□□□ 0.45	5e-6	■□□□□ 11.2
RRN3-205	ENST00000563559	PCMT1	P22061	227 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SEMG2	Q02383	582 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VMAC	Q2NL98	169 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SYT12	Q8IV01	421 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VOPP1	Q96AW1	172 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	BRD9	Q9H8M2	597 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GPX2	P18283	190 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CHIT1	Q13231	466 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CARD16	Q5EG05	197 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	PYCR2	Q96C36	320 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	EGLN2	Q96KS0	407 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CSF3R	Q99062	836 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	APOL4	Q9BPW4	351 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ABCG8	Q9H221	673 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SCN3B	Q9NY72	215 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		17.87	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CARNS1	A5YM72	827 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	BNIP3L	O60238	219 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS2	O75306	463 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FABP3	P05413	133 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	JUND	P17535	347 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ENG	P17813	658 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FPR1	P21462	350 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	C21orf58	P58505	322 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F8	P98187	520 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	IRF8	Q02556	426 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GSTM4	Q03013	218 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RAPSN	Q13702	412 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H3	Q13889	308 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL8	Q96CD0	374 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	GRM6	O15303	877 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	AP2A2	O94973	939 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK5	O95279	499 aa		17.86	■□□□□ 0.45
RRN3-205	ENST00000563559	FTH1	P02794	183 aa		17.86	■□□□□ 0.45

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