RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.31	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222		F8W8V4	182 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	WISP2	O76076	250 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	HAUS5	O94927	633 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	AHSG	P02765	367 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FTH1	P02794	183 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ESR1	P03372	595 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLC2A4	P14672	509 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	COX6B1	P14854	86 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	GABRB3	P28472	473 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FMO4	P31512	558 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ACY1	Q03154	408 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	IQCF5	A8MTL0	148 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222		H3BMM5	538 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PIAS1	O75925	651 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	STS	P08842	583 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	IDS	P22304	550 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CCR7	P32248	378 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	STX2	P32856	288 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ARL4D	P49703	201 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	VSNL1	P62760	191 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	D2HGDH	Q8N465	521 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	CTSB	P07858	339 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	RRAD	P55042	308 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	HSD11B2	P80365	405 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	RPA4	Q13156	261 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	ART3	Q13508	389 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	NCF4	Q15080	339 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CS-231	ENST00000552222	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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