RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CDC16Q13042 620 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LCP2Q13094 533 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NR1D2Q14995 579 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NR0B2Q15466 257 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RBBP7Q16576 425 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CFAP157Q5JU67 520 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CUZD1Q86UP6 607 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 AGR3Q8TD06 166 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NEIL2Q969S2 332 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CNDP1Q96KN2 507 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR2A14Q96R47 310 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SLC38A3Q99624 504 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 MIPEPQ99797 713 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 IPPKQ9H8X2 491 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 UCK1Q9HA47 277 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PNPOQ9NVS9 261 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 THAP1Q9NVV9 213 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 HAO1Q9UJM8 370 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PADI4Q9UM07 663 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RP1P56715 2156 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PIPSLA2A3N6 862 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CPED1A4D0V7 1026 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GSAPA4D1B5 854 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ISM1B1AKI9 464 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PROB1E7EW31 1015 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SH3BP5O60239 455 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PRAMEF10O60809 474 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KATNA1O75449 491 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 UBXN7O94888 489 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR4F21O95013 312 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PROS1P07225 676 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ALPPL2P10696 532 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PVRP15151 417 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GLB1P16278 677 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EPB42P16452 691 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 DRD4P21917 467 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ALDH4A1P30038 563 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SERPINB5P36952 375 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 HSD17B2P37059 387 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CAPZBP47756 277 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ID4P47928 161 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PIK3CGP48736 1102 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 HTR6P50406 440 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GFERP55789 205 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ASPHQ12797 758 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CHIT1Q13231 466 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 DOC2AQ14183 400 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 E2F2Q14209 437 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ICE2Q659A1 982 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ATG16L1Q676U5 607 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LCTLQ6UWM7 567 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 MAVSQ7Z434 540 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SPRED1Q7Z699 444 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR2L3Q8NG85 312 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms