RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.55□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.55□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.55□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PI4KAP42356 2102 aa7.55□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 LAMA5O15230 3695 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR6C74A6NCV1 312 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF839A8K0R7 811 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM114B3SHH9 223 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ITM2AO43736 263 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KDM1AO60341 852 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NRP2O60462 931 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NPHS1O60500 1241 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 WFS1O76024 890 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SUPT7LO94864 414 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 UBXN7O94888 489 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 WDR47O94967 919 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 C9P02748 559 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CHRNGP07510 517 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 UGT2B7P16662 529 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CKMT2P17540 419 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CCND1P24385 295 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ACP1P24666 158 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GRK2P25098 689 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CD1CP29017 333 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CASP2P42575 452 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PIK3CGP48736 1102 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ACADVLP49748 655 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NAA20P61599 178 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SH3BP2P78314 561 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CLCQ05315 142 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CDC16Q13042 620 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 RCN2Q14257 317 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 KRT33BQ14525 404 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 INAVAQ3KP66 663 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ICE2Q659A1 982 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF425Q6IV72 752 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 LCTLQ6UWM7 567 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SYVN1Q86TM6 617 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 FAM129CQ86XR2 697 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TEX9Q8N6V9 391 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR2L3Q8NG85 312 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 AGAP11Q8TF27 550 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NAT6Q93015 286 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NEIL2Q969S2 332 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MED8Q96G25 268 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CNDP1Q96KN2 507 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MAGEB18Q96M61 343 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PPM1MQ96MI6 270 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF382Q96SR6 550 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MIPEPQ99797 713 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NTMT1Q9BV86 223 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 EHD1Q9H4M9 534 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PDP2Q9P2J9 529 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OPTCQ9UBM4 332 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TAC3Q9UHF0 121 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.54□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 PIPSLA2A3N6 862 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 OR2A25A4D2G3 310 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 C2orf74A8MZ97 194 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 E7EQ34 232 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 MATN2O00339 956 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 TNFSF14O43557 240 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 DKK1O94907 266 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 GP1BAP07359 652 aa7.53□□□□□ -1.2
C16orf62-211ENST00000540101 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms