RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537320.5

TNC-211, Transcript of tenascin C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNC, Length 4,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNC-211ENST00000537320 NTHL1P78549 312 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RANBP10Q6VN20 620 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SVOPLQ8N434 492 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 OR51B5Q9H339 312 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 CITO14578 2027 aa11.1□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SCN7AQ01118 1682 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 NDUFS4O43181 175 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TSPAN6O43657 245 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 GMFGO60234 142 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 NOBOXO60393 691 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 GSK3BP49841 420 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 AMZ1Q400G9 498 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TRPV1Q8NER1 839 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 FAM110BQ8TC76 370 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 HM13Q8TCT9 377 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RIT1Q92963 219 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 GLYATL1Q969I3 302 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 AXIN1O15169 862 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 GBAP04062 536 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 PGRP06401 933 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ACRV1P26436 265 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RPS6KA3P51812 740 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 DEFB103AP81534 67 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SPANXN4Q5MJ08 99 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SMARCD2Q92925 531 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 HCSTQ9UBK5 93 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 FZD4Q9ULV1 537 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 LAMA4Q16363 1823 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 CCNB2O95067 398 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 IL7RP16871 459 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 MPIP34949 423 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 HMGCLP35914 325 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 EMX2Q04743 252 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RTL4Q6ZR62 310 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 COX18Q8N8Q8 333 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ENKURQ8TC29 256 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 AP3S1Q92572 193 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 C1orf21Q9H246 121 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 CTPS2Q9NRF8 586 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 MKS1Q9NXB0 559 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 MCM8Q9UJA3 840 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 NENFQ9UMX5 172 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 MCIDASD6RGH6 385 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 EI24O14681 340 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RGS10O43665 173 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ADH1BP00325 375 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TNFP01375 233 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 KHKP50053 298 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 DIO3P55073 304 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 RPS13P62277 151 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 ANO7Q6IWH7 933 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TMEM74Q96NL1 305 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.63
TNC-211ENST00000537320 MPZL2O60487 215 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 GADD45GO95257 159 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 ALDH4A1P30038 563 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 SCARB2Q14108 478 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 RABL3Q5HYI8 236 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 RNF220Q5VTB9 566 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 AHSA2Q719I0 299 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 KCT2Q8NC54 265 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 ZNF382Q96SR6 550 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.08□□□□□ -0.64
TNC-211ENST00000537320 DMTF1Q9Y222 760 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms