RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CAPN1P07384 714 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ABHD2P08910 425 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CD63P08962 238 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PLA2G2AP14555 144 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ELK3P41970 407 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GRIA3P42263 894 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TCTE1Q5JU00 501 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FCRL6Q6DN72 434 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 LCN10Q6JVE6 187 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CYS1Q717R9 158 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 OR2L3Q8NG85 312 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ASB11Q8WXH4 323 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SMPDL3AQ92484 453 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GBP5Q96PP8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PPCSQ9HAB8 311 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TCFL5Q9UL49 500 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.99■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 A0A1W2PPV9 198 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 KRT87PA6NCN2 255 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GFYI3L273 518 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB14O43829 449 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 RFPL1O75677 317 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FAM153BP0C7A2 387 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CMPK1P30085 196 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 RGS4P49798 205 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ARSFP54793 590 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 DCDP81605 110 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 IL10RAQ13651 578 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FAM153CQ494X1 144 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 STEAP4Q687X5 459 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CROCCP2Q86T23 111 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PALM2Q8IXS6 379 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PKP4Q99569 1192 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 MIPEPQ99797 713 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.98■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ATP8B1O43520 1251 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CCNDBP1O95273 360 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PSMB5P28074 263 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GCGRP47871 477 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PNLIPRP1P54315 467 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GRM7Q14831 915 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 HDXQ7Z353 690 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CFAP36Q96G28 342 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CCDC77Q9BR77 488 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 A0A1B0GX78 115 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SLC28A2O43868 658 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SLC16A8O95907 504 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 AHSGP02765 367 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CTSBP07858 339 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 GABRB3P28472 473 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 STX2P32856 288 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 SP140Q13342 867 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 C1orf189Q5VU69 101 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 RNF44Q7L0R7 432 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PKP3-209ENST00000533069 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms