RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 NEMFO60524 1076 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 SPARCP09486 303 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 TSPY4P0CV99 314 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 TSPY10P0CW01 314 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 GLULP15104 373 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 FERP16591 822 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 KLK2P20151 261 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 NMBRP28336 390 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 HSPA1LP34931 641 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 KRT20P35900 424 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 TRDNQ13061 729 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 PPP2R5CQ13362 524 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 XKR3Q5GH77 459 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 GRTP1Q5TC63 336 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 PP632Q6XCG6 107 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 NLRP14Q86W24 1093 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 MAPK15Q8TD08 544 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 CFAP36Q96G28 342 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PPH5 198 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 FSD2A1L4K1 749 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 NDC80O14777 642 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 SFTPCP11686 197 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 HECTD3Q5T447 861 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 TEX11Q8IYF3 940 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 NUP85Q9BW27 656 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 ZWILCHQ9H900 591 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 MED4Q9NPJ6 270 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 MRGBPQ9NV56 204 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 CTSZQ9UBR2 303 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-220ENST00000531466 AASSQ9UDR5 926 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-220ENST00000531466 SHISA9B4DS77 424 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED4O75132 1171 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 LRCH4O75427 683 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 SCGB1D1O95968 90 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 CCR9P51686 369 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-220ENST00000531466 HSD17B7P56937 341 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 NDPQ00604 133 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 MTF1Q14872 753 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 ODF2Q5BJF6 829 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 FHL5Q5TD97 284 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-220ENST00000531466 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.33□□□□□ -1.88
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