RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1B0GX78 115 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 HYKKA2RU49 373 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2A25A4D2G3 310 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNDC9O14530 226 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 CTSVO60911 334 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-210ENST00000505941 POU4F1Q01851 419 aa20.19■□□□□ 0.82
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